RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa12.68□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 IGSF22Q8N9C0 903 aa12.68□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 OSBPL7Q9BZF2 842 aa12.68□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP12.68□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 MAGEB2O15479 319 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 MED24O75448 989 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 LYPLA2O95372 231 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CXCL10P02778 98 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 PFKMP08237 780 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 NPEPPSP55786 919 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM62Q0P6H9 643 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 DTHD1Q6ZMT9 781 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 RSPH3Q86UC2 560 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01465Q8N7H1 131 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP26B1Q9NR63 512 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 LRWD1Q9UFC0 647 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CLIC4Q9Y696 253 aa12.67□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 FGBP02675 491 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 RPA1P27694 616 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 BECN1Q14457 450 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 PTPAQ15257 358 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 RASIP1Q5U651 963 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 EFCAB12Q6NXP0 572 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 OTOP2Q7RTS6 562 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 NME8Q8N427 588 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 LRRC71Q8N4P6 559 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 METTL13Q8N6R0 699 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 ERMNQ8TAM6 284 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 TUFT1Q9NNX1 390 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CDY2AQ9Y6F7 541 aa12.66□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A087WWV3 80 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 VWA3AA6NCI4 1184 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 PP2D1A8MPX8 630 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 MAFO75444 373 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 BMP15O95972 392 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CDC25AP30304 524 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CLCN3P51790 818 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 DRP2Q13474 957 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 ECM1Q16610 540 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 TCTN1Q2MV58 587 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 IER5Q5VY09 327 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 HAUS3Q68CZ6 603 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 OTUD6AQ7L8S5 288 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 PIGOQ8TEQ8 1089 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 HERVK_113Q902F9 699 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CEP170P1Q96L14 293 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 USP28Q96RU2 1077 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB34Q9BZG1 259 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 SUGCTQ9HAC7 445 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 F13A1P00488 732 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 VTNP04004 478 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 TMOD1P28289 359 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 RARRES1P49788 294 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 GRIN1Q05586 938 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 LRIT3Q3SXY7 679 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 XKR9Q5GH70 373 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXO47Q5MNV8 452 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CNKSR3Q6P9H4 555 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 CDHR5Q9HBB8 845 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKEF1Q9NU02 776 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 PPME1Q9Y570 386 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 TRPV2Q9Y5S1 764 aa12.65□□□□□ -0.38
CCL3L3-201ENST00000612839 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 MICAL3Q7RTP6 2002 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 PTPRSQ13332 1948 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 M0QZ92 97 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR32O75388 356 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC34A2O95436 690 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 GHRP10912 638 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 MUTP22033 750 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 LPIN1Q14693 890 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 SNX29Q8TEQ0 813 aa12.64□□□□□ -0.39
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC7A3Q8WY07 619 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms