RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 NT5C1BQ96P26 610 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TESK2Q96S53 571 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ZBED4O75132 1171 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 INAQ16352 499 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ARMCX2Q7L311 632 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 NLRP14Q86W24 1093 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TBK1Q9UHD2 729 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TNRQ92752 1358 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC22O60826 627 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ANO9A1A5B4 782 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 CXCR5P32302 372 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PASD1Q8IV76 773 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 NR2F2P24468 414 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SEMA3FQ13275 785 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SLC39A6Q13433 755 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ADCK1Q86TW2 530 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ITSN1Q15811 1721 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 MFAP3LO75121 409 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 MOCS3O95396 460 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 KLC1Q07866 573 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL12Q53G59 568 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TTC39CQ8N584 583 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 STAP2Q9UGK3 403 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SNX2O60749 519 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 GGPS1O95749 300 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SURF1Q15526 300 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 NAA35Q5VZE5 725 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SRLQ86TD4 932 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 CYTH2Q99418 400 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM13O60858 407 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 JAK1P23458 1154 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TIMM10P62072 90 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 GRM1Q13255 1194 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 CUL4AQ13619 759 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ACSL3O95573 720 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 BAG6P46379 1132 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 USH1GQ495M9 461 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ENOPH1Q9UHY7 261 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 HIF1AQ16665 826 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 STAMQ92783 540 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
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PTPRT-209ENST00000612229 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ADRM1Q16186 407 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 PROM2Q8N271 834 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 ELMOD1Q8N336 334 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 TSPOAP1O95153 1857 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 RASA4BC9J798 803 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-209ENST00000612229 RASA4O43374 803 aa7.43□□□□□ -1.22
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