RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 IL31Q6EBC2 164 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TSSK4Q6SA08 328 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 SLC39A11Q8N1S5 342 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 IL31RAQ8NI17 732 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 RHPN1Q8TCX5 695 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ADAM33Q9BZ11 813 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ZBP1Q9H171 429 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 MLXIPQ9HAP2 919 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 RNF19AQ9NV58 838 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ABCB11O95342 1321 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 LAMA4Q16363 1823 aa13.52□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 FGFR1P11362 822 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ATP5JP18859 108 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ZNF543Q08ER8 600 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 METTL7BQ6UX53 244 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CABP7Q86V35 215 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 GLG1Q92896 1179 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ZNF558Q96NG5 402 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 MYADMQ96S97 322 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 RXFP3Q9NSD7 469 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 DACH1Q9UI36 760 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.51□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TSPY2A6NKD2 308 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ANHXE9PGG2 379 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 NOP56O00567 594 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 OPLAHO14841 1288 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 GPAA1O43292 621 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 KCNK5O95279 499 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 HSD17B4P51659 736 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 KRT17Q04695 432 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PPARAQ07869 468 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PPFIA1Q13136 1202 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 HTR4Q13639 388 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 WTAPQ15007 396 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 C8orf34Q49A92 452 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 VSIG10LQ86VR7 867 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 LURAP1LQ8IV03 231 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 IFNL3Q8IZI9 196 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 SPG21Q9NZD8 308 aa13.5□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TENM4Q6N022 2769 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CLUHO75153 1309 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 RBM25P49756 843 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 SEMA3FQ13275 785 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PGM5Q15124 567 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 GRIK4Q16099 956 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CCDC6Q16204 474 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PRR23BQ6ZRT6 265 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 LRRC43Q8N309 656 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TMEM57Q8N5G2 664 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 APPBP2Q92624 585 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CLDN23Q96B33 292 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 SHDQ96IW2 340 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CASD1Q96PB1 797 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TMEM47Q9BQJ4 181 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TMEM117Q9H0C3 514 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 RGS18Q9NS28 235 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 C1orf112Q9NSG2 853 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TMEM161AQ9NX61 479 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 RAB23Q9ULC3 237 aa13.49□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 GNAT2P19087 354 aa13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PTMSP20962 102 aa13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 IER5Q5VY09 327 aa13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 CEP85Q6P2H3 762 aa13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ADAM32Q8TC27 787 aa13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 AUTS2Q8WXX7 1259 aa13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.48□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 DOCK5Q9H7D0 1870 aa13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 M0R2C6 588 aa13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 PAPLNO95428 1278 aa13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 SPINK2P20155 84 aa13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 RPS9P46781 194 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HCG18-241ENST00000602290 FAM189BP81408 668 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms