RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-216	ENST00000596536	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SEPT2	Q15019	361 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	BACH1	O14867	736 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	OPA1	O60313	960 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	UCHL3	P15374	230 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	TRAF1	Q13077	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	EMB	Q6PCB8	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	FAM86B1	E9PN63	330 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ABCB4	P21439	1286 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	COPB2	P35606	906 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SEC24C	P53992	1094 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	IQCD	Q96DY2	449 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	GFPT2	O94808	682 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	HLA-DOA	P06340	250 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ITGA4	P13612	1032 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	HOXD13	P35453	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ZNF76	P36508	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SLC8A3	P57103	927 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	IFT88	Q13099	833 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	GIT2	Q14161	759 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	PLCB4	Q15147	1175 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	CEP63	Q96MT8	703 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	DNM3	Q9UQ16	869 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	MEIS2	O14770	477 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	BBOX1	O75936	387 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	PON1	P27169	355 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	NOV	P48745	357 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	PAK2	Q13177	524 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	COG2	Q14746	738 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SAAL1	Q96ER3	474 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	DPH5	Q9H2P9	285 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	PLAA	Q9Y263	795 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	ABCB11	O95342	1321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	EML1	O00423	815 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FCHO1-216	ENST00000596536	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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