RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ISM2Q6H9L7 571 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TPH2Q8IWU9 490 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SCFD2Q8WU76 684 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 BAP1Q92560 729 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RIT2Q99578 217 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DISC1Q9NRI5 854 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DACT1Q9NYF0 836 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 B4DLN1 442 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LAD1O00515 517 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 BACH1O14867 736 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CTAGE5O15320 804 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF862O60290 1169 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 STAM2O75886 525 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SLITRK3O94933 977 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 STBD1O95210 358 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GH1P01241 217 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MYL3P08590 195 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP4AP20648 1035 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXD10P28358 340 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GRK4P32298 578 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 UBA7P41226 1012 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 STAT6P42226 847 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SYKP43405 635 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NPEPPSP55786 919 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNH2Q12809 1159 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 IRF5Q13568 498 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 EPHA7Q15375 998 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TLK2Q86UE8 772 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PHOX2BQ99453 314 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR20Q99678 358 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LXNQ9BS40 222 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MAF1Q9H063 256 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ARID2Q68CP9 1835 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NFASCO94856 1347 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR64B1ANS9 1081 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 BIN1O00499 593 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 HMGCRP04035 888 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PSAPP07602 524 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP3P08254 477 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 AKR1A1P14550 325 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SOX10P56693 466 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKCEQ02156 737 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PNOCQ13519 176 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NEDD9Q14511 834 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MTERF2Q49AM1 385 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT79Q5XKE5 535 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL7BQ6UX53 244 aa6.74□□□□□ -1.33
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