RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC25AP30304 524 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 DNM2P50570 870 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 MGAT3Q09327 533 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 PDIA5Q14554 519 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 BRAPQ7Z569 592 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RPAINQ86UA6 219 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 C4orf19Q8IY42 314 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 MTMR6Q9Y217 621 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CLIC4Q9Y696 253 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 VWA3AA6NCI4 1184 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 PP2D1A8MPX8 630 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 LAD1O00515 517 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 UPP2O95045 317 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CD52P31358 61 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 PBX2P40425 430 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNJ6P48051 423 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RABGGTBP53611 331 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RESTQ13127 1097 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 DRP2Q13474 957 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 LPIN1Q14693 890 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 KIZQ2M2Z5 673 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RASIP1Q5U651 963 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.192e-7■□□□□ 8.2
EFTUD2-211ENST00000588374 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 KSR1Q8IVT5 923 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ERMNQ8TAM6 284 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 SEPT8Q92599 483 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM143Q96AN5 459 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 NACC1Q96RE7 527 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP89Q96ST8 783 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP7D2Q96T17 732 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 PLIN2Q99541 437 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB34Q9BZG1 259 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP290O15078 2479 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ENPP3O14638 875 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR32O75388 356 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS6KA5O75582 802 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 LYPLA2O95372 231 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 MYOGP15173 224 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RPA1P27694 616 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPHP41219 470 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB103AP81534 67 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 ECM1Q16610 540 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT79Q5XKE5 535 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-211ENST00000588374 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms