RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900		E9PMD0	336 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	ITGB8	P26012	769 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	RFC2	P35250	354 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	THPO	P40225	353 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	DNM2	P50570	870 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	IER5	Q5VY09	327 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900		A0A087WWV3	80 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	SYN1	P17600	705 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	PLCG1	P19174	1290 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	CYP2C18	P33260	490 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	MGAT3	Q09327	533 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	EMC2	Q15006	297 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	MTR	Q99707	1265 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	KCND2	Q9NZV8	630 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PQ27	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PQ64	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PQD8	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900		H0YGN5	161 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	ASAP2	O43150	1006 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	PLA2G4B	P0C869	781 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	CYP11B2	P19099	503 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	CMA1	P23946	247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	CLCN3	P51790	818 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	RAD54L	Q92698	747 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	BAD	Q92934	168 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	PLIN2	Q99541	437 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKN1-208	ENST00000586900	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900		M0QZ92	97 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CHRNA1	P02708	482 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CXCL10	P02778	98 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PFKM	P08237	780 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CCL23	P55773	120 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	FPGS	Q05932	587 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22	2e-6	■■■■□ 21.5
PKN1-208	ENST00000586900	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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