RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 CNTD1Q8N815 330 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 COG1Q8WTW3 980 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 PTPDC1A2A3K4 754 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 MSL3P1P0C860 447 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 FPR2P25090 351 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 HK2P52789 917 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 MVKQ03426 396 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP44Q17R89 818 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 SYDE2Q5VT97 1194 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 GALNT18Q6P9A2 607 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC120Q96HB5 630 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM169Q96HH4 297 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 KCNJ15Q99712 375 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 PLCD4Q9BRC7 762 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 JAM3Q9BX67 310 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 IMPACTQ9P2X3 320 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 FBLN5Q9UBX5 448 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 CBLCQ9ULV8 474 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 FITM1A5D6W6 292 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 C22orf46C9J442 243 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRM-208ENST00000578600 GNAT1P11488 350 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRM-208ENST00000578600 SCYL1Q96KG9 808 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRM-208ENST00000578600 EMC7Q9NPA0 242 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRM-208ENST00000578600 H7C1D1 291 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRM-208ENST00000578600 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 MROH9Q5TGP6 573 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 NLRX1Q86UT6 975 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 SHISA4Q96DD7 197 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 MENTQ9BUN1 341 aa6.97□□□□□ -1.29
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