RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-206ENST00000571409 DGKIO75912 1065 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 FOSBP53539 338 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 XKR3Q5GH77 459 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 BANK1Q8NDB2 785 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 GPR182O15218 404 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 STAG3L1P0CL83 205 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 PPP2R5CQ13362 524 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 GPM6BQ13491 265 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 CRIPAKQ8N1N5 446 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 TNFRSF25Q93038 417 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 VAV3Q9UKW4 847 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 VCANP13611 3396 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 H3BNC9 293 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 EML1O00423 815 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 MGEA5O60502 916 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 MMP1P03956 469 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 TFF2Q03403 129 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 MTERF2Q49AM1 385 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM228AQ86W67 206 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 POTEDQ86YR6 584 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 DENND3A2RUS2 1198 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM150BA6NC51 233 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 TBX3O15119 743 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 MARCH6O60337 910 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 STBD1O95210 358 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 LINC00271P0C7V0 271 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 CTNNB1P35222 781 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 TRIM29Q14134 588 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 HAS1Q92839 578 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 COG5Q9UP83 839 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 PSMC5P62195 406 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 ADAM2Q99965 735 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 SH2D3AQ9BRG2 576 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 ADAMTS10Q9H324 1103 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 LRFN2Q9ULH4 789 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 RWDD3Q9Y3V2 267 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 BTBD18B2RXH4 712 aa34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 SARSP49591 514 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 PTPROQ16827 1216 aa34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 IL27Q8NEV9 243 aa34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 RGS18Q9NS28 235 aa34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-206ENST00000571409 DDX11L8A8MPP1 907 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 C5orf67F2Z3F1 127 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 BMPR1AP36894 532 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 AAK1Q2M2I8 961 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCDC83Q8IWF9 413 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF710Q8N1W2 664 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 HLA-CQ95604 372 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 CEP89Q96ST8 783 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 C1orf112Q9NSG2 853 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 RB1P06400 928 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 GPC3P51654 580 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 KIF2CQ99661 725 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 BAG4O95429 457 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 QARSP47897 775 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 DRP2Q13474 957 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC24A5Q71RS6 500 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 ANO5Q75V66 913 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLFN12Q8IYM2 578 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 SCLT1Q96NL6 688 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 CUL9Q8IWT3 2517 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 GATMP50440 423 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 PLA2G4FQ68DD2 849 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 KIAA1671Q9BY89 1806 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 C9IYK1 514 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 P4HBP07237 508 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 KCNQ1P51787 676 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 NCAPH2Q6IBW4 605 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 NLRP7Q8WX94 980 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 XIRP2A4UGR9 3374 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 DSC3Q14574 896 aa34.02■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 EPHA7Q15375 998 aa34.02■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 TIGD5Q53EQ6 642 aa34.02■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms