RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 NUP58Q9BVL2 599 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 CCNA1P78396 465 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 CST9Q5W186 159 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 STRA6Q9BX79 667 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF302Q9NR11 478 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 PPP1R37O75864 691 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 ATG7O95352 703 aa22.96■■□□□ 1.27
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SPNS1-212ENST00000568900 MTF1Q14872 753 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 LY6KQ17RY6 165 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 PLXNB2O15031 1838 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 GGPS1O95749 300 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 TNNT1P13805 278 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 PEX3P56589 373 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 RETREG2Q8NC44 543 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-212ENST00000568900 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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SPNS1-212ENST00000568900 CASP4P49662 377 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 PTPN14Q15678 1187 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 GBP3Q9H0R5 595 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 ARIH2O95376 493 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 FECHP22830 423 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPNS1-212ENST00000568900 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 PTPN18Q99952 460 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 CCP110O43303 1012 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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SPNS1-212ENST00000568900 DESI2Q9BSY9 194 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPNS1-212ENST00000568900 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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SPNS1-212ENST00000568900 DNAJC7Q99615 494 aa22.93■■□□□ 1.26
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SPNS1-212ENST00000568900 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 SLC16A4O15374 487 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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SPNS1-212ENST00000568900 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.93■■□□□ 1.26
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SPNS1-212ENST00000568900 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 MORC4Q8TE76 937 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 KIFAP3Q92845 792 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 ACCSQ96QU6 501 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-212ENST00000568900 A0A1W2PQJ5 194 aa22.91■■□□□ 1.26
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