RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 PPP6R2O75170 966 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 MGAT3Q09327 533 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM62Q0P6H9 643 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.799e-8■■■■□ 25.5
SPNS1-208ENST00000566059 DRP2Q13474 957 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 SPECC1Q5M775 1068 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 HYIQ5T013 277 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 USP49Q70CQ1 688 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 CABP7Q86V35 215 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 PNMA5Q96PV4 448 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 NBNO60934 754 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 TMOD1P28289 359 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 BMP8BP34820 402 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 RFC2P35250 354 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 RFC5P40937 340 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 UBA7P41226 1012 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 GRB10Q13322 594 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 KCNK18Q7Z418 384 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 DEFB128Q7Z7B8 93 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 SLC7A3Q8WY07 619 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 EPSTI1Q96J88 318 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 OSBPL7Q9BZF2 842 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 IL23AQ9NPF7 189 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 RCOR1Q9UKL0 485 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 CDY2AQ9Y6F7 541 aa19.98■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 PARNO95453 639 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 VTNP04004 478 aa19.97■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 ACRP10323 421 aa19.97■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 IER5Q5VY09 327 aa19.97■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 PLIN2Q99541 437 aa19.97■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 E9PMD0 336 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 EXOC8Q8IYI6 725 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 GBP4Q96PP9 640 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 CDHR5Q9HBB8 845 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 DNM3Q9UQ16 869 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 AKT3Q9Y243 479 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 EVPLQ92817 2033 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 LAMA3Q16787 3333 aa19.96■□□□□ 0.79
SPNS1-208ENST00000566059 TANC1Q9C0D5 1861 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 SLC26A4O43511 780 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 CXCL10P02778 98 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 DNM2P50570 870 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 KRT85P78386 507 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 EMC2Q15006 297 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM119Q4V9L6 283 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 MAP7D2Q96T17 732 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 CCSER1Q9C0I3 900 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 NT5C3AQ9H0P0 336 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 BHMT2Q9H2M3 363 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 TRPV2Q9Y5S1 764 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 SCN5AQ14524 2016 aa19.95■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 GPR32O75388 356 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 DGAT1O75907 488 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 EYA4O95677 639 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 KARSQ15046 597 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 KIZQ2M2Z5 673 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM240Q5SV17 173 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 C9orf50Q5SZB4 431 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF365Q70YC5 407 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 KCTD17Q8N5Z5 321 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM143Q96AN5 459 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 CALML4Q96GE6 196 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 PPP1R16BQ96T49 567 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGEF35A5YM69 484 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 M0QZ92 97 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 USO1O60763 962 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 CUTAO60888 179 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 PFKMP08237 780 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 PADI6Q6TGC4 694 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC15Q8TF66 581 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 MTRQ99707 1265 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 ADAMTS10Q9H324 1103 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 PCDHA7Q9UN72 937 aa19.94■□□□□ 0.78
SPNS1-208ENST00000566059 GINS2Q9Y248 185 aa19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms