RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TPH2	Q8IWU9	490 aa		20.08	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SLC5A5	Q92911	643 aa		20.08	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	20.08	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ISCU	Q9H1K1	167 aa		20.08	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ESYT3	A0FGR9	886 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	CEP104	O60308	925 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	LMNB1	P20700	586 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	PRELP	P51888	382 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	TTMP	Q5BVD1	217 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	NACC1	Q96RE7	527 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	CSRNP1	Q96S65	589 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	STK33	Q9BYT3	514 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		20.07	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	FAM153B	P0C7A2	387 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	KCNA1	Q09470	495 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R5A	Q15172	486 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	FAM153C	Q494X1	144 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	STYK1	Q6J9G0	422 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ARL8A	Q96BM9	186 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GOPC	Q9HD26	462 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SCN9A	Q15858	1988 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PRG0	241 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GAS7	O60861	476 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	CFB	P00751	764 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SOX5	P35711	763 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF131	P52739	623 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GNGT1	P63211	74 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	DYDC2	Q96IM9	177 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		20.06	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SFI1	A8K8P3	1242 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	20.05	■□□□□ 0.8	4e-7	■■■■□ 20.8
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	FMO5	P49326	533 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	EMC10	Q5UCC4	262 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	WDR18	Q9BV38	432 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559		F8VZ95	297 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559		H0YIN7	160 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GUCY2F	P51841	1108 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	CORO7	P57737	925 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	JAG1	P78504	1218 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	CEP55	Q53EZ4	464 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	METTL13	Q8N6R0	699 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	AKT1S1	Q96B36	256 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC45	Q96CN5	670 aa		20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF233	A6NK53	670 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	EBAG9	O00559	213 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	EVI5	O60447	810 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	KRT14	P02533	472 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	RFX1	P22670	979 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEA9	P43362	315 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	DAAM2	Q86T65	1068 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	TMX2	Q9Y320	296 aa		20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	20.04	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM66	O15016	1216 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	CHMP2A	O43633	222 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	MYBPC2	Q14324	1141 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	20.03	■□□□□ 0.8	2e-8	■■□□□ 12.8
RRN3-205	ENST00000563559	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	DMAC2	Q9NW81	257 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GRIN2D	O15399	1336 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	KRIT1	O00522	736 aa		20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	20.03	■□□□□ 0.8
RRN3-205	ENST00000563559	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8

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