RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563295.1

KIFC3-215, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-215	ENST00000563295	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	EML1	O00423	815 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	STAG3L1	P0CL83	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	DNM2	P50570	870 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	GRB10	Q13322	594 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	CALCRL	Q16602	461 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	MTERF2	Q49AM1	385 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	SPRED2	Q7Z698	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	TTC3	P53804	2025 aa		11.16	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	LPXN	O60711	386 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	STBD1	O95210	358 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	EPHA7	Q15375	998 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	EPC2	Q52LR7	807 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	ANO5	Q75V66	913 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	FIBCD1	Q8N539	461 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	SCLT1	Q96NL6	688 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	OSMR	Q99650	979 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	ADAM2	Q99965	735 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	PPME1	Q9Y570	386 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	WDR81	Q562E7	1941 aa		11.15	□□□□□ -0.62
KIFC3-215	ENST00000563295	VCAN	P13611	3396 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SI	P14410	1827 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TMEM150B	A6NC51	233 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	DLL1	O00548	723 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	NEMF	O60524	1076 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	DGKI	O75912	1065 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CEP89	Q96ST8	783 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	LXN	Q9BS40	222 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	KIF3A	Q9Y496	699 aa		11.14	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295		H3BNC9	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	RB1	P06400	928 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ATP2B1	P20020	1258 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	MCM7	P33993	719 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	BMPR1A	P36894	532 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TXK	P42681	527 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	MCM2	P49736	904 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	GPC3	P51654	580 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TPH2	Q8IWU9	490 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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