RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 GALK1P51570 392 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 CORO7P57737 925 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRM1Q13255 1194 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 TESK1Q15569 626 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 MCM10Q7L590 875 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 NIM1KQ8IY84 436 aa11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPIP5K2O43314 1243 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 DLX3O60479 287 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PNLIPP16233 465 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRKCAP17252 672 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 CXCL9Q07325 125 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUP43Q8NFH3 380 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 OSBP2Q969R2 916 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 VPS33BQ9H267 617 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF609O15014 1411 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCC4O15439 1325 aa11.06□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARNTLO00327 626 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRODHO43272 600 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 MVKQ03426 396 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 NOGQ13253 232 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBLAC2Q68D91 279 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 IQCEQ6IPM2 695 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC6A17Q9H1V8 727 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAGE1Q9NXZ1 904 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa11.05□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCTN1Q14203 1278 aa11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 SUSD4Q5VX71 490 aa11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 NSMFQ6X4W1 530 aa11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC103Q8IW40 242 aa11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.04□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PQ27 194 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PQ64 194 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PQC6 194 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PQD8 194 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 C7orf72A4D263 438 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 YDJCA8MPS7 323 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM153BP0C7A2 387 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 MSL3P1P0C860 447 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP4F8P98187 520 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNAB2Q13303 367 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIF1Q9H611 641 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDLIM7Q9NR12 457 aa11.03□□□□□ -0.64
USP3-AS1-204ENST00000559861 SHTN1A0MZ66 631 aa11.02□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPTP24298 496 aa11.02□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM10P98175 930 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 INF2Q27J81 1249 aa11.02□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.02□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 LILRB2Q8N423 598 aa11.02□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 DIO2Q92813 273 aa11.02□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa11.02□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPHS1O60500 1241 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARL4AP40617 200 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERVFRD-1P60508 538 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAX4O43316 350 aa11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 LTBRP36941 435 aa11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOX10P56693 466 aa11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 HUNKP57058 714 aa11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 PARP10Q53GL7 1025 aa11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11□□□□□ -0.65
USP3-AS1-204ENST00000559861 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms