RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 CYP2C8P10632 490 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 CCND1P24385 295 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 EPHB3P54753 998 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 ROM1Q03395 351 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 ADCY2Q08462 1091 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 TOR2AQ5JU69 321 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 STK32CQ86UX6 486 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 CHPFQ8IZ52 775 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 SGPP1Q9BX95 441 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 GALNT8Q9NY28 637 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.15□□□□□ -1.42
PRPF39-212ENST00000557477 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 PEX10O60683 326 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 OSMP13725 252 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ECE1P42892 770 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 GLRBP48167 497 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ITGA1P56199 1179 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 KRT85P78386 507 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 RTP5Q14D33 572 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 MZB1Q8WU39 189 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 DLL4Q9NR61 685 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 IL18BPO95998 194 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 MTNR1BP49286 362 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 IL13RA1P78552 427 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 HTRA3P83110 453 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ADAM9Q13443 819 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ACAP2Q15057 778 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 MLANAQ16655 118 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 UGT8Q16880 541 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 KCNK18Q7Z418 384 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 CPA6Q8N4T0 437 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 CALML6Q8TD86 181 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 JADE3Q92613 823 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TEKT5Q96M29 485 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 MTG2Q9H4K7 406 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.13□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 KLHL33A6NCF5 533 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 PCDH8O95206 1070 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 PFKMP08237 780 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 CELA3BP08861 270 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 PF4V1P10720 104 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 AGXTP21549 392 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 LIMS1P48059 325 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM240Q5SV17 173 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 CCDC181Q5TID7 509 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 MCTP1Q6DN14 999 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 NOX5Q96PH1 765 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM209Q96SK2 561 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 OR10A5Q9H207 317 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 GCM1Q9NP62 436 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 INVSQ9Y283 1065 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.12□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 SMARCA2P51531 1590 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 PFKLP17858 780 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF39-212ENST00000557477 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms