RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADAM15	Q13444	863 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	POF1B	Q8WVV4	589 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	MSH4	O15457	936 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	ALAD	P13716	330 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	CLCN3	P51790	818 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	EVC	P57679	992 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	DISC1	Q9NRI5	854 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4R4-204	ENST00000555690	WDR64	B1ANS9	1081 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	MBTPS2	O43462	519 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM167A	Q96KS9	214 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	AKT3	Q9Y243	479 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAGEB2	O15479	319 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	USP11	P51784	963 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	NLRP5	P59047	1200 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	RUFY3	Q7L099	469 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	HCST	Q9UBK5	93 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	CD207	Q9UJ71	328 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHMP2A	O43633	222 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF862	O60290	1169 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	OAT	P04181	439 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	NRIP1	P48552	1158 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	NDUFV1	P49821	464 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM189B	P81408	668 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	GJA10	Q969M2	543 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	RIT2	Q99578	217 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	DCX	O43602	365 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	GAS7	O60861	476 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	FGFR1	P11362	822 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRKCE	Q02156	737 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	DSC3	Q14574	896 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	TBCK	Q8TEA7	893 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC5A5	Q92911	643 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAP7D2	Q96T17	732 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	AAAS	Q9NRG9	546 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRR33	A8MZF0	331 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMOD1	P28289	359 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	UGCG	Q16739	394 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	EFHB	Q8N7U6	833 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	CLEC1B	Q9P126	229 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	FGF18	O76093	207 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	SFN	P31947	248 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	CWH43	Q9H720	699 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	WDR81	Q562E7	1941 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	JAK3	P52333	1124 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBE3A	Q05086	875 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690		Q4G0T1	1027 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	TLE6	Q9H808	572 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	TLR9	Q9NR96	1032 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	CPLX1	O14810	134 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	PER2	O15055	1255 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	PSMD10	O75832	226 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	TDP2	O95551	362 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4R4-204	ENST00000555690	EYA4	O95677	639 aa		27.55	■■■□□ 2

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