RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ZAR1	Q86SH2	424 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	KSR1	Q8IVT5	923 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	USP6NL	Q92738	828 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PORCN	Q9H237	461 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	INCENP	Q9NQS7	918 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	MTMR7	Q9Y216	660 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A0D9SFI3	127 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	HIP1	O00291	1037 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PRMT3	O60678	531 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	MSC	O60682	206 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PRDM1	O75626	825 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNA5	P22460	613 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	HAND2	P61296	217 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PDE4B	Q07343	736 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	FAAP100	Q0VG06	881 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ACAP1	Q15027	740 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC41	Q15345	812 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ST3GAL2	Q16842	350 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR78	Q5VTH9	848 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR142	Q7Z601	462 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	SPRED2	Q7Z698	418 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	SWAP70	Q9UH65	585 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PLXNA3	P51805	1871 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TECTA	O75443	2155 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PARP14	Q460N5	1801 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	MCM3AP	O60318	1980 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PRR23A	A6NEV1	266 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	C19orf81	C9J6K1	198 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994		H0Y858	1186 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF213	O14771	459 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TIAF1	O95411	115 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TIMP1	P01033	207 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	CA3	P07451	260 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TSPY3	P0CV98	308 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TSPY8	P0CW00	308 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	CYBA	P13498	195 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	AKR1B1	P15121	316 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	SHMT1	P34896	483 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TFAP4	Q01664	338 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PPARA	Q07869	468 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	VPS53	Q5VIR6	699 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	MFSD5	Q6N075	450 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ACER1	Q8TDN7	264 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	RMDN1	Q96DB5	314 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	HHIP	Q96QV1	700 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TLR9	Q9NR96	1032 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		5.48	□□□□□ -1.53

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