RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 CDIP1Q9H305 208 aa6.97□□□□□ -1.29
USP15-218ENST00000552346 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.97□□□□□ -1.29
USP15-218ENST00000552346 DLL4Q9NR61 685 aa6.97□□□□□ -1.29
USP15-218ENST00000552346 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.97□□□□□ -1.29
USP15-218ENST00000552346 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.97□□□□□ -1.29
USP15-218ENST00000552346 K7ESF4 209 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 WNT9AO14904 365 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 KLHL18O94889 574 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CKMP06732 381 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 PYGMP11217 842 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ID4P47928 161 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 TMPRSS15P98073 1019 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 FAPQ12884 760 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 PAK1Q13153 545 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 Q6ZUG5 572 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 PASD1Q8IV76 773 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CNTD1Q8N815 330 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 MTMR8Q96EF0 704 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.96□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 TRAF5O00463 557 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 GABRDO14764 452 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 MSCO60682 206 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 FBXO21O94952 628 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 FKBP9O95302 570 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CHPFQ8IZ52 775 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CDH19Q9H159 772 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.95□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 M0R2C6 588 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 SCGB1D2O95969 90 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CHGBP05060 677 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 LSSP48449 732 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 LRRC41Q15345 812 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 HS1BP3Q53T59 392 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CERS3Q8IU89 383 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 NXPE1Q8N323 547 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 GNRHR2Q96P88 292 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ALG1Q9BT22 464 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CABP5Q9NP86 173 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.94□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 GSTA4O15217 222 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 GAS7O60861 476 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 KNG1P01042 644 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 OCRLQ01968 901 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 KLF10Q13118 480 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 KIZQ2M2Z5 673 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 TMEM177Q53S58 311 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 AJUBAQ96IF1 538 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 LMF1Q96S06 567 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 TNKSO95271 1327 aa6.93□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 FOXS1O43638 330 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ULK1O75385 1050 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 RFPL1O75677 317 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 FAHP16930 419 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 CSF2RBP32927 897 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 GNALP38405 381 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 GLRBP48167 497 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 IL2P60568 153 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 TUSC3Q13454 348 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.92□□□□□ -1.3
USP15-218ENST00000552346 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.92□□□□□ -1.3
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