RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 SREBF1P36956 1147 aa27.86■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 PTPN21Q16825 1174 aa27.86■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ANKRD54Q6NXT1 300 aa27.86■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.86■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 APOA5Q6Q788 366 aa27.86■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.86■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.86■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ZBTB42B2RXF5 422 aa27.85■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ATP4AP20648 1035 aa27.85■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 PBX3P40426 434 aa27.85■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 RTN1Q16799 776 aa27.85■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.85■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ASIC4Q96FT7 647 aa27.85■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 S1PR5Q9H228 398 aa27.85■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 HIDE1A8MVS5 230 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 FAM86B1E9PN63 330 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 C22orf31O95567 290 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 FAM86B2P0C5J1 330 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 FAM189BP81408 668 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 AP3B2Q13367 1082 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 NIPA1Q7RTP0 329 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ABI1Q8IZP0 508 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 RNF169Q8NCN4 708 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 TCEANC2Q96MN5 208 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 LZTS1Q9Y250 596 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 USP34Q70CQ2 3546 aa27.84■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ZBTB43O43298 467 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 GPR32O75388 356 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 AVPR2P30518 371 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 NECTIN1Q15223 517 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 SYCE2Q6PIF2 218 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 KCNT2Q6UVM3 1135 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 TMC7Q7Z402 723 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 BARHL2Q9NY43 387 aa27.83■■■□□ 2.05
MACROD1-208ENST00000545464 DHX15O43143 795 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 ST18O60284 1047 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 CA8P35219 290 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 CLCN3P51790 818 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 PLCB3Q01970 1234 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 KRT17Q04695 432 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 LRRC55Q6ZSA7 311 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF558Q96NG5 402 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 CASD1Q96PB1 797 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF577Q9BSK1 485 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 AKT3Q9Y243 479 aa27.82■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 HOXA2O43364 376 aa27.81■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 FUT2Q10981 343 aa27.81■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 KCNC3Q14003 757 aa27.81■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 DSC3Q14574 896 aa27.81■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.81■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 CDH22Q9UJ99 828 aa27.81■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 EVPLQ92817 2033 aa27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 GOLGA8AA7E2F4 631 aa27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 GFRA3O60609 400 aa27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 LRRC43Q8N309 656 aa27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 SPG21Q9NZD8 308 aa27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 GABBR1Q9UBS5 961 aa27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 SAMM50Q9Y512 469 aa27.8■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 PSAPP07602 524 aa27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 PPM1AP35813 382 aa27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 KREMEN2Q8NCW0 462 aa27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 MAP7D2Q96T17 732 aa27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 RNF19AQ9NV58 838 aa27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 NR2E1Q9Y466 385 aa27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa27.78■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 RNF20Q5VTR2 975 aa27.78■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 CES5AQ6NT32 575 aa27.78■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 EFCAB12Q6NXP0 572 aa27.78■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 LRRC71Q8N4P6 559 aa27.78■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 SCLT1Q96NL6 688 aa27.78■■■□□ 2.04
MACROD1-208ENST00000545464 TBC1D22BQ9NU19 505 aa27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms