RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.38	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.38	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.38	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	TGM5	O43548	720 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	SCNN1B	P51168	640 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	RRAD	P55042	308 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	RNF180	Q86T96	592 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	PTPN18	Q99952	460 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.37	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	GPR42	O15529	346 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	LSS	P48449	732 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	MRE11	P49959	708 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	STAT5B	P51692	787 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	OCRL	Q01968	901 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	NFYC	Q13952	458 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC32	Q14392	662 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	TBR1	Q16650	682 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	LMF1	Q96S06	567 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.36	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	FKBP9	O95302	570 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	CD40	P25942	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	STAT3	P40763	770 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	MEOX1	P50221	254 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	IL2	P60568	153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	RAC3	P60763	192 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	PHC1	P78364	1004 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	DHCR24	Q15392	516 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	MATN2	O00339	956 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	BPI	P17213	487 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	MASP1	P48740	699 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	BCAR1	P56945	870 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	ANTXR2	P58335	489 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	HGFAC	Q04756	655 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	TERF2	Q15554	542 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	DGKD	Q16760	1214 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	CFHR4	Q92496	578 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MDM2-233	ENST00000545204	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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