RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	GJA8	P48165	433 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	DNM2	P50570	870 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PNOC	Q13519	176 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	EMC2	Q15006	297 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.2	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	MYMK	A6NI61	221 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	STBD1	O95210	358 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	HIP1R	O75146	1068 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	KLRC1	P26715	233 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	CUL4B	Q13620	913 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PANK4	Q9NVE7	773 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	HTT	P42858	3142 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	C22orf31	O95567	290 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	CYP2C9	P11712	490 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	GAP43	P17677	238 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	DPYD	Q12882	1025 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	GIT2	Q14161	759 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	IER5	Q5VY09	327 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PARVG	Q9HBI0	331 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SI	P14410	1827 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658		M0QZ92	97 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	ARVCF	O00192	962 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	CASP1	P29466	404 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	CLCN3	P51790	818 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	SMTN	P53814	917 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DDB1-223	ENST00000543658	COASY	Q13057	564 aa		13.16	□□□□□ -0.3

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