RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 KDELC1Q6UW63 502 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 IFT81Q8WYA0 676 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 NCLNQ969V3 563 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 CCDC42Q96M95 316 aa6.68□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 TINF2Q9BSI4 451 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 CAP2P40123 477 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 SCNN1DP51172 638 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 CYP4A11Q02928 519 aa6.68□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 STK11Q15831 433 aa6.68□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 SSH3Q8TE77 659 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.68□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 EHD2Q9NZN4 543 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 ELP1O95163 1332 aa6.68□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 TMEM127O75204 238 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 MYZAPP0CAP1 466 aa6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 CCDC63Q8NA47 563 aa6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 PLVAPQ9BX97 442 aa6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 EURLQ9NYK6 297 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 MALT1Q9UDY8 824 aa6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 FAM182BQ5T319 152 aa6.67□□□□□ -1.34
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LMO3-225ENST00000541295 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 FATE1Q969F0 183 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 OTUD5Q96G74 571 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 TBATAQ96M53 351 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.67□□□□□ -1.34
LMO3-225ENST00000541295 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.67□□□□□ -1.34
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