RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WNK4Q96J92 1243 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAF1Q9H063 256 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RLFQ13129 1914 aa6.34□□□□□ -1.39
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 B4DLN1 442 aa6.33□□□□□ -1.4
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP6R2O75170 966 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TOMM70O94826 608 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARSDP51689 593 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCL15Q16663 113 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEK8Q86SG6 692 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXorf38Q8TB03 319 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATG4CQ96DT6 458 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFT43Q96FT9 208 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP28Q96RU2 1077 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC30A3Q99726 388 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YY1AP1Q9H869 796 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXO40Q9UH90 709 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAD1O00515 517 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CUTAO60888 179 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PEX14O75381 377 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MICAL2O94851 1124 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHA2P01877 340 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPXP11678 715 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 YY1P25490 414 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STAT3P40763 770 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP11P51784 963 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INHBEP58166 350 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCNA1P78396 465 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FSTL1Q12841 308 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTA1Q13330 715 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC39A14Q15043 492 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF174Q15697 407 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INF2Q27J81 1249 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LETM2Q2VYF4 491 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR78Q5VTH9 848 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RGMBQ6NW40 437 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMC7Q7Z402 723 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYT9Q86SS6 491 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBCKQ8TEA7 893 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB34Q9BZG1 259 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLF15Q9UIH9 416 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLIC4Q9Y696 253 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.33□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIN3BO75182 1162 aa6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC25A27O95847 323 aa6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MCM7P33993 719 aa6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HERVK_113P62684 666 aa6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FANCCQ00597 558 aa6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SREBF2Q12772 1141 aa6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBE2SQ16763 222 aa6.32□□□□□ -1.4
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.32□□□□□ -1.4
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