RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.78□□□□□ -0.52
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABI1Q8IZP0 508 aa11.77□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS52Q8N1B4 723 aa11.77□□□□□ -0.53
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC30A4O14863 429 aa11.76□□□□□ -0.53
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC39A11Q8N1S5 342 aa11.76□□□□□ -0.53
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.75□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NETO1Q8TDF5 533 aa11.75□□□□□ -0.53
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GHRHRQ02643 423 aa11.74□□□□□ -0.53
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1QTNF9P0C862 333 aa11.73□□□□□ -0.53
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD72P21854 359 aa11.73□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLRC2P26717 231 aa11.73□□□□□ -0.53
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.73□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.73□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBP1Q9H171 429 aa11.73□□□□□ -0.53
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL4A3Q01955 1670 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEDD4P46934 1319 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM170BA6NMN3 283 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOBPA7XYQ1 873 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXA2O43364 376 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBC1D4O60343 1298 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STAM2O75886 525 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIZQ2M2Z5 673 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLRX1Q86UT6 975 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM228AQ86W67 206 aa11.72□□□□□ -0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NME8Q8N427 588 aa11.72□□□□□ -0.53
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