RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	OSMR	Q99650	979 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557		R4GN57	208 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	EOMES	O95936	686 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CYP21A2	P08686	494 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	MTHFR	P42898	656 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CUL5	Q93034	780 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ACACB	O00763	2458 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	FRYL	O94915	3013 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-222	ENST00000533557	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	KRBA1	A5PL33	1030 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	CXCL14	O95715	111 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	VTN	P04004	478 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	PTH1R	Q03431	593 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	SIX5	Q8N196	739 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	GPR182	O15218	404 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	MAFG	O15525	162 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	KRT17	Q04695	432 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	WTAP	Q15007	396 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	EVPL	Q92817	2033 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	C22orf31	O95567	290 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	RXRA	P19793	462 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	TDG	Q13569	410 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	NFASC	O94856	1347 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557		E7EWF7	191 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	HBP1	O60381	514 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	B4GALT3	O60512	393 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	FGFR4	P22455	802 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	PPM1A	P35813	382 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	BCAR1	P56945	870 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BBS1-222	ENST00000533557	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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