RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527197.5

PUF60-209, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUF60, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-209ENST00000527197 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 C19orf81C9J6K1 198 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 CXCL11O14625 94 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TADA3O75528 432 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ZNF131P52739 623 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 OAZ1P54368 228 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TUBB2AQ13885 445 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 PGM5Q15124 567 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 PDXDC1Q6P996 788 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 RNF207Q6ZRF8 634 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 KIAA1328Q86T90 577 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 SLC35F6Q8N357 371 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 CARD6Q9BX69 1037 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 PARVGQ9HBI0 331 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 RNF146Q9NTX7 359 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 CEP72Q9P209 647 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 PLAGL2Q9UPG8 496 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 LCTP09848 1927 aa15.87■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 CTAGE9A4FU28 777 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ERCC3P19447 782 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 GUCY2CP25092 1073 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 CTGFP29279 349 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 HOXD13P35453 343 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 MTMR1Q13613 665 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 MYCT1Q8N699 235 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 BANK1Q8NDB2 785 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 BAP1Q92560 729 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 JAKMIP2Q96AA8 810 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TAAR1Q96RJ0 339 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 PXMP2Q9NR77 195 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.86■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 LRRC53A6NM62 1247 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 EFCAB8A8MWE9 144 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 NR3C1P04150 777 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 PSMC4P43686 418 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 HMGCS2P54868 508 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 KCNMA1Q12791 1236 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 NFIL3Q16649 462 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 NSMFQ6X4W1 530 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 REPS2Q8NFH8 660 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 CYP2C8P10632 490 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 DSG3P32926 999 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 RRAGAQ7L523 313 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 CCDC42Q96M95 316 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 RMDN3Q96TC7 470 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 MYPNQ86TC9 1320 aa15.84■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ZBTB39O15060 712 aa15.83■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 KRT86O43790 486 aa15.83■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 LYPLA2O95372 231 aa15.83■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 NMT1P30419 496 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 VAV2P52735 878 aa15.83■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 SPA17Q15506 151 aa15.83■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.83■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.83■□□□□ 0.13
PUF60-209ENST00000527197 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms