RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522821.5

TTC13-209, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

TSL 4

Gene TTC13, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-209ENST00000522821 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.15■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 MBOAT7Q96N66 472 aa26.15■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 ADAM2Q99965 735 aa26.15■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 PLVAPQ9BX97 442 aa26.15■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 RGS18Q9NS28 235 aa26.15■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 AKT3Q9Y243 479 aa26.15■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26.15■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 PFKFB2O60825 505 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 CSPG5O95196 566 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 INF2Q27J81 1249 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 MIER3Q7Z3K6 550 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 ETNPPLQ8TBG4 499 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 MAP7D2Q96T17 732 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.14■■□□□ 1.78
TTC13-209ENST00000522821 STK36Q9NRP7 1315 aa26.14■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 MMP1P03956 469 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 TMOD1P28289 359 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 COL19A1Q14993 1142 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 B3GNT9Q6UX72 402 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 RDM1Q8NG50 284 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 NEK9Q8TD19 979 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.13■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 C9IYK1 514 aa26.12■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 COL9A1P20849 921 aa26.12■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 ANAPC15P60006 121 aa26.12■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.12■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 P2RX5Q93086 422 aa26.12■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 ADAMTS10Q9H324 1103 aa26.12■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 GJB4Q9NTQ9 266 aa26.12■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 SLC37A4O43826 429 aa26.11■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 AK2P54819 239 aa26.11■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 CAMK1Q14012 370 aa26.11■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 LETM2Q2VYF4 491 aa26.11■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 CLDND1Q9NY35 253 aa26.11■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 EVPLQ92817 2033 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 CTDNEP1O95476 244 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 ITGB1P05556 798 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 IL9P15248 144 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 DSC3Q14574 896 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 KLHL23Q8NBE8 558 aa26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 TMEM150BA6NC51 233 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 TBKBP1A7MCY6 615 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 XBP1P17861 261 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 DNAJB1P25685 340 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 HYAL1Q12794 435 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 ANKRD1Q15327 319 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 MTERF2Q49AM1 385 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 NAALADL2Q58DX5 795 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 XKR3Q5GH77 459 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 SPPL3Q8TCT6 385 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 OXER1Q8TDS5 423 aa26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 STBD1O95210 358 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 GPC3P51654 580 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 FAM189BP81408 668 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 NEK8Q86SG6 692 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 CD320Q9NPF0 282 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC13-209ENST00000522821 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 FGFR1P11362 822 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 LTBRP36941 435 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 DRP2Q13474 957 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 SCLT1Q96NL6 688 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 CEP89Q96ST8 783 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 HCSTQ9UBK5 93 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 MYO7AQ13402 2215 aa26.07■■□□□ 1.76
TTC13-209ENST00000522821 NCK2O43639 380 aa26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms