RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522224.3

TBC1D9B-216, Transcript of TBC1 domain family member 9B, humanhuman

TSL 5

Gene TBC1D9B, Length 532 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9B-216ENST00000522224 LARGE1O95461 756 aa20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 SEC24BO95487 1268 aa20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 GTF3C6Q969F1 213 aa20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 SCLT1Q96NL6 688 aa20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 ADAM2Q99965 735 aa20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.58■□□□□ 0.89
TBC1D9B-216ENST00000522224 MGEA5O60502 916 aa20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 GPR32O75388 356 aa20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 RB1P06400 928 aa20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 BMP1P13497 986 aa20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 KRT2P35908 639 aa20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 MTERF2Q49AM1 385 aa20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 XKR3Q5GH77 459 aa20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 BANK1Q8NDB2 785 aa20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 FAM228AQ86W67 206 aa20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 RGS18Q9NS28 235 aa20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 CSPG5O95196 566 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 GATMP50440 423 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 FOSBP53539 338 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 TRIM29Q14134 588 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 FAM20AQ96MK3 541 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.55■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 TTC28Q96AY4 2481 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 TMEM150BA6NC51 233 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 LINC00271P0C7V0 271 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 DNM2P50570 870 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 PSMC5P62195 406 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 NR5A1Q13285 461 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 NLRP7Q8WX94 980 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.54■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 REV3LO60673 3130 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 EML1O00423 815 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 GRM6O15303 877 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 KCNA5P22460 613 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 GPC3P51654 580 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 PPP2R5CQ13362 524 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 POTEDQ86YR6 584 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 PLVAPQ9BX97 442 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 LMAN2LQ9H0V9 348 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 VAV3Q9UKW4 847 aa20.53■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 FAM205CA6NFA0 338 aa20.52■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.52■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 C9IYK1 514 aa20.52■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 TBX3O15119 743 aa20.52■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 JAK2O60674 1132 aa20.52■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.52■□□□□ 0.88
TBC1D9B-216ENST00000522224 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 STBD1O95210 358 aa20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 MMP1P03956 469 aa20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 DRP2Q13474 957 aa20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 ANO5Q75V66 913 aa20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 HAS1Q92839 578 aa20.51■□□□□ 0.87
TBC1D9B-216ENST00000522224 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms