RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518468.1

RB1CC1-205, Transcript of RB1 inducible coiled-coil 1, human

TSL 3

Gene RB1CC1, Length 507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RB1CC1-205	ENST00000518468	PFKP	Q01813	784 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468		Q6ZUG5	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	GPR42	O15529	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	AKAP10	O43572	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	B4GALT4	O60513	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PAK1	Q13153	545 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468		A0A087X0B3	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	MATN3	O15232	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	EFCAB14	O75071	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	IL18BP	O95998	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	NAT1	P18440	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	GABRE	P78334	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PICALM	Q13492	652 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ICAM4	Q14773	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	GPR19	Q15760	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	RNF180	Q86T96	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	ARVCF	O00192	962 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	FBXO21	O94952	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CSF2RB	P32927	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	NEK4	P51957	841 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	MTMR1	Q13613	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CDSN	Q15517	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RB1CC1-205	ENST00000518468	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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