RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 A0A0G2JNJ9 132 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 CUTAO60888 179 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADCY1Q08828 1119 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 DDB1Q16531 1140 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 BROXQ5VW32 411 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 C11orf74Q86VG3 221 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCYL1Q96KG9 808 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 MYL10Q9BUA6 226 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 Q9UFV3 132 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 MSRAQ9UJ68 235 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 FBXO10Q9UK96 956 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-410P-201ENST00000517006 KDM1AO60341 852 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 BRINP1O60477 761 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 HMGCRP04035 888 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 LSP1P33241 339 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 CNR2P34972 360 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 STAT5BP51692 787 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCNQ1P51787 676 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 NFKB2Q00653 900 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF827Q17R98 1081 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 LCE4AQ5TA78 99 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 C20orf173Q96LM9 149 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 INVSQ9Y283 1065 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPR39O43194 453 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 ULK1O75385 1050 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 RRADP55042 308 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMPRSS15P98073 1019 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 AMPD3Q01432 767 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADCY2Q08462 1091 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 BORAQ6PGQ7 559 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 FERMT3Q86UX7 667 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 LGI4Q8N135 537 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 TEPSINQ96N21 525 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 OPHN1O60890 802 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 APOL3O95236 402 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 BCAR1P56945 870 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 SESN3P58005 492 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 ANTXR2P58335 489 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAP3K12Q12852 859 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 PDCD1Q15116 288 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 TBR1Q16650 682 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 AGBL4Q5VU57 503 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM124AQ86V42 546 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 RASSF3Q86WH2 238 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 WDR48Q8TAF3 677 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 WDR66Q8TBY9 1149 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 COG1Q8WTW3 980 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPATCH3Q96I76 525 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 MTG2Q9H4K7 406 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 VTA1Q9NP79 307 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms