RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 CFHR4Q92496 578 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 EDAQ92838 391 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 OR10A2Q9H208 303 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 ASB1Q9Y576 335 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.7□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 RASSF10A6NK89 507 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 SLPIP03973 132 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 STAT5BP51692 787 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 HMGA2P52926 109 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 IRF9Q00978 393 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 DUSP8Q13202 625 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM177Q53S58 311 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 C2orf27AQ580R0 203 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 JMYQ8N9B5 988 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 CALML6Q8TD86 181 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 DLG3Q92796 817 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MKL1Q969V6 931 aa6.69□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 SDHAP31040 664 aa6.68□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.68□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.68□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 FAM89AQ96GI7 184 aa6.68□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MRIQ9BWK5 157 aa6.68□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 KCNQ2O43526 872 aa6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 KRT37O76014 449 aa6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 NPTXRO95502 500 aa6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 KCNA6P17658 529 aa6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 FOXE3Q13461 319 aa6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 Q6ZSN1 163 aa6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MSL2Q9HCI7 577 aa6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.67□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MAP3K12Q12852 859 aa6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 EXTL1Q92935 676 aa6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 BOCQ9BWV1 1114 aa6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 CSRNP2Q9H175 543 aa6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.65□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 SUV39H1O43463 412 aa6.65□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 HGFACQ04756 655 aa6.65□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 FOXL1Q12952 345 aa6.65□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 MIIPQ5JXC2 388 aa6.65□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.65□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.65□□□□□ -1.34
RUFY3-215ENST00000515479 SLC26A4O43511 780 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 RAPGEF3O95398 923 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 KLF10Q13118 480 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 GPR135Q8IZ08 494 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 LILRB2Q8N423 598 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF503Q96F45 646 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 NELFAQ9H3P2 528 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 TLR9Q9NR96 1032 aa6.64□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 M0R2C6 588 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 PLD2O14939 933 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 KIF11P52732 1056 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 HHEXQ03014 270 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 PTH1RQ03431 593 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 ADAM15Q13444 863 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 GRM7Q14831 915 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 E2F7Q96AV8 911 aa6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms