RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509351.5

VNN3-211, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-211ENST00000509351 POU4F1Q01851 419 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 TTLL4Q14679 1199 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 STARD3Q14849 445 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 GRIK5Q16478 980 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 GGT6Q6P531 493 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 PANK1Q8TE04 598 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 TRIM47Q96LD4 638 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 FBXL18Q96ME1 805 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 FOXQ1Q9C009 403 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.22□□□□□ -1.41
VNN3-211ENST00000509351 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 PRXQ9BXM0 1461 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 CD3EP07766 207 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 PDE6AP16499 860 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ELF1P32519 619 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ZNF543Q08ER8 600 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 POSTNQ15063 836 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 TAF11Q15544 211 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 KCNK18Q7Z418 384 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 NUDT8Q8WV74 236 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 GMCL1Q96IK5 515 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 EDARQ9UNE0 448 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 PHF24Q9UPV7 400 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.21□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 KRBA1A5PL33 1030 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 TM4SF5O14894 197 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 AURKAO14965 403 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 FGF18O76093 207 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 SLITRK5O94991 958 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 PLS3P13797 630 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 KRT9P35527 623 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 GRK3P35626 688 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 KCNAB2Q13303 367 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 PRKG1Q13976 671 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 SNX17Q15036 470 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 TAF5Q15542 800 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 APOA5Q6Q788 366 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 RFX8Q6ZV50 586 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 DAAM2Q86T65 1068 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ESX1Q8N693 406 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ISL2Q96A47 359 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ZFP42Q96MM3 310 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ASPNQ9BXN1 380 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 SP110Q9HB58 689 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 CLEC1BQ9P126 229 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.2□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 SLC35F4A4IF30 521 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 POM121BA6NF01 834 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 B4E171 279 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 TISP43B9A030 160 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 B9A039 149 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 MEIS1O00470 390 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 FFAR2O15552 330 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 POLBP06746 335 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 TGFB3P10600 412 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 TSPAN7P41732 249 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 KIF11P52732 1056 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 ARL4CP56559 192 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 JAM2P57087 298 aa6.19□□□□□ -1.42
VNN3-211ENST00000509351 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms