RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EXD1Q8NHP7 514 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 IFT74Q96LB3 600 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NDC80O14777 642 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ADCY3O60266 1144 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KRT75O95678 551 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 F13A1P00488 732 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SERPINC1P01008 464 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KRT10P13645 584 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 VAV1P15498 845 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GNAZP19086 355 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KRT6CP48668 564 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ATP1A2P50993 1020 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SEC24CP53992 1094 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TMF1P82094 1093 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TCIRG1Q13488 830 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CCNJLQ8IV13 435 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CAGE1Q8TC20 777 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 OTUD5Q96G74 571 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PGBD1Q96JS3 809 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 FANCEQ9HB96 536 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 E9PBE3 544 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ICMTO60725 284 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TJP3O95049 919 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KRT6AP02538 564 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KRT6BP04259 564 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RGS2P41220 211 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MTHFRP42898 656 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RXRGP48443 463 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GUCY1A3Q02108 690 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 BBS5Q8N3I7 341 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NAT14Q8WUY8 206 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PALMDQ9NP74 551 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 HSF2BPO75031 334 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ADAM23O75077 832 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SFTPCP11686 197 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF3P17036 446 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GNA11P29992 359 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NEK4P51957 841 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 USP14P54578 494 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CDK18Q07002 472 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ITGA9Q13797 1035 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 UBE4AQ14139 1066 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GSTA3Q16772 222 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SGO2Q562F6 1265 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ANO5Q75V66 913 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TMC7Q7Z402 723 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NUP93Q8N1F7 819 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 EHD2Q9NZN4 543 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KRBA1A5PL33 1030 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGEF15O94989 841 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CHEK2O96017 543 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NR1D1P20393 614 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CALB2P22676 271 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GSSP48637 474 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PLCD1P51178 756 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CCR3P51677 355 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 DNAJC3Q13217 504 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KLHL35Q6PF15 583 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 C4orf22Q6V702 233 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ITIH5Q86UX2 942 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.64□□□□□ -1.35
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