RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.61■■□□□ 1.37
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SH3BP2-210ENST00000505941 MTMR9Q96QG7 549 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 YME1L1Q96TA2 773 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-210ENST00000505941 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.61■■□□□ 1.37
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SH3BP2-210ENST00000505941 NLRP7Q8WX94 980 aa23.59■■□□□ 1.37
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SH3BP2-210ENST00000505941 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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SH3BP2-210ENST00000505941 POTEMA6NI47 508 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 LYPLA2O95372 231 aa23.54■■□□□ 1.36
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SH3BP2-210ENST00000505941 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.54■■□□□ 1.36
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SH3BP2-210ENST00000505941 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF410Q86VK4 478 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 FIBCD1Q8N539 461 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP89Q96ST8 783 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 ADAM2Q99965 735 aa23.53■■□□□ 1.36
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