RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	RASGRF1	Q13972	1273 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT32	Q14532	448 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RAPH1	Q70E73	1250 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RTL10	Q7L3V2	364 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC43	Q8N309	656 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	LILRB2	Q8N423	598 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM58	Q8NG06	486 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PALD1	Q9ULE6	856 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TAF1	P21675	1872 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	XDH	P47989	1333 aa		7.44	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PRU2	124 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	P4HA2	O15460	535 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ICMT	O60725	284 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TSC22D2	O75157	780 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	NPR1	P16066	1061 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RPS6KB1	P23443	525 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMA5	P28066	241 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TMOD1	P28289	359 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP2K2	P36507	400 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RENBP	P51606	427 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMD7	P51665	324 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	MNAT1	P51948	309 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	LIMK1	P53667	647 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	EVC	P57679	992 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	MCL1	Q07820	350 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	KIF5A	Q12840	1032 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	COG2	Q14746	738 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RCN1	Q15293	331 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	SP8	Q8IXZ3	490 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX11	Q96FC9	970 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	MRGBP	Q9NV56	204 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	MAST3	O60307	1309 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	LTBP1	Q14766	1721 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971		J3KRW8	73 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	NDC80	O14777	642 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	PIP5K1C	O60331	668 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	DAB1	O75553	588 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	S100A6	P06703	90 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	MMP10	P09238	476 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RAD52	P43351	418 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ASMT	P46597	345 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	RPS6KA3	P51812	740 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	NEK4	P51957	841 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	BLVRA	P53004	296 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	VAC14	Q08AM6	782 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	TUBA3C	Q13748	450 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	ALX1	Q15699	326 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	CLUL1	Q15846	466 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FBXO38-208	ENST00000504971	XP32	Q5T750	250 aa		7.42	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms