RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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PTPRU-207ENST00000492954 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 AKT3Q9Y243 479 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 MUC3AQ02505 3323 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 EVPLQ92817 2033 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 H3BNC9 293 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 EML1O00423 815 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 STBD1O95210 358 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 LINC00271P0C7V0 271 aa20.28■□□□□ 0.84
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PTPRU-207ENST00000492954 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 BANK1Q8NDB2 785 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 FAM20AQ96MK3 541 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 GPR182O15218 404 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRU-207ENST00000492954 GPM6BQ13491 265 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 MTERF2Q49AM1 385 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 XKR3Q5GH77 459 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRU-207ENST00000492954 POTEDQ86YR6 584 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTPRU-207ENST00000492954 DENND3A2RUS2 1198 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRU-207ENST00000492954 TBX3O15119 743 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRU-207ENST00000492954 GPC3P51654 580 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRU-207ENST00000492954 KIF2CQ99661 725 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 RGS18Q9NS28 235 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTPRU-207ENST00000492954 MARCH6O60337 910 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM29Q14134 588 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 AAK1Q2M2I8 961 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 C9IYK1 514 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 RB1P06400 928 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 DSC3Q14574 896 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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PTPRU-207ENST00000492954 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 SCLT1Q96NL6 688 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 WNT7AO00755 349 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 GRM6O15303 877 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 BMP1P13497 986 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 GUCY1B3Q02153 619 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 NLRP7Q8WX94 980 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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