RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	PP2D1	A8MPX8	630 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	ZBBX	A8MT70	800 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	GPR32	O75388	356 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	BAIAP3	O94812	1187 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	28.83	■■■□□ 2.21	3e-6	■■□□□ 14.4
TTC3-223	ENST00000492275	SEPT8	Q92599	483 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	RAB34	Q9BZG1	259 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	AKT3	Q9Y243	479 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	PPME1	Q9Y570	386 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TTC3-223	ENST00000492275	GBF1	Q92538	1859 aa		28.83	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	BMP15	O95972	392 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	CDC25A	P30304	524 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	PKP1	Q13835	747 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	IKBKE	Q14164	716 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	PTPA	Q15257	358 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	POTEG	Q6S5H5	508 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	MAP7D2	Q96T17	732 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	GINS2	Q9Y248	185 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	RARRES1	P49788	294 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	MUT	P22033	750 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	RFC5	P40937	340 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	NACC1	Q96RE7	527 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	STK24	Q9Y6E0	443 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	LAMA3	Q16787	3333 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	CD52	P31358	61 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	GPC3	P51654	580 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	USP38	Q8NB14	1042 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	USP28	Q96RU2	1077 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	OSMR	Q99650	979 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	DNM2	P50570	870 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	GRIN1	Q05586	938 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	BECN1	Q14457	450 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	KRT79	Q5XKE5	535 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	28.78	■■■□□ 2.2	4e-10	■■■■■ 31.1
TTC3-223	ENST00000492275	APBB2	Q92870	758 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	PADI3	Q9ULW8	664 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	F13A1	P00488	732 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	DEFB103A	P81534	67 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	EMC2	Q15006	297 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM143	Q96AN5	459 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TTC3-223	ENST00000492275	EFCAB14	O75071	495 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	KSR1	Q8IVT5	923 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	SLC9A7	Q96T83	725 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	DGAT1	O75907	488 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	PBX2	P40425	430 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	KCNJ6	P48051	423 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	MTR	Q99707	1265 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	RPS6KA5	O75582	802 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	RABGGTB	P53611	331 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	PAK2	Q13177	524 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	SLC39A14	Q15043	492 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	HYI	Q5T013	277 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19

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