RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 AMFRQ9UKV5 643 aa11.13□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SNX24Q9Y343 169 aa11.13□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 MED24O75448 989 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 CLTAP09496 248 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SLC8A1P32418 973 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PRKCIP41743 596 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SLCO1A2P46721 670 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 IFNAR2P48551 515 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 CASP4P49662 377 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PMS2P54278 862 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PLTPP55058 493 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 AADACL2Q6P093 401 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 HOOK3Q86VS8 718 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 P3H4Q92791 437 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 GCNT4Q9P109 453 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 NAV1Q8NEY1 1877 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 MEIS1O00470 390 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 RFC4P35249 363 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 NT5C2P49902 561 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PTENP60484 403 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 DUPD1Q68J44 220 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 TEX11Q8IYF3 940 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC63Q8NA47 563 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 CUL5Q93034 780 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.12□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SMARCA1P28370 1054 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SLC16A2P36021 539 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 MMP13P45452 471 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 JAM2P57087 298 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PPP4CP60510 307 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PSMC6P62333 389 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 KLRC3Q07444 240 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SLC29A2Q14542 456 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 NAA25Q14CX7 972 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 HYIQ5T013 277 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 DENND2CQ68D51 928 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 VPS36Q86VN1 386 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SFR1Q86XK3 245 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 WDR66Q8TBY9 1149 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 NEK9Q8TD19 979 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 CENPTQ96BT3 561 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 ERP44Q9BS26 406 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 RAB17Q9H0T7 212 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 ABCF3Q9NUQ8 709 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 CLIC2O15247 247 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 SLC12A3P55017 1021 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 GSTO1P78417 241 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 MYO1EQ12965 1108 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC38Q502W7 563 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 NLRP3Q96P20 1036 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.11□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 RPTORQ8N122 1335 aa11.1□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 EVI5O60447 810 aa11.1□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 NUDT17P0C025 328 aa11.1□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 KRT13P13646 458 aa11.1□□□□□ -0.63
VWA3B-217ENST00000489630 KCNA1Q09470 495 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms