RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488339.1

PRPSAP1-208, Transcript of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 1, human

TSL 2

Gene PRPSAP1, Length 443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	WDR81	Q562E7	1941 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HSCB	Q8IWL3	235 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CERS4	Q9HA82	394 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	STBD1	O95210	358 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GJB5	O95377	273 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DNM2	P50570	870 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DRP2	Q13474	957 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CUL4A	Q13619	759 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GRIN2C	Q14957	1233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	USP38	Q8NB14	1042 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MYLIP	Q8WY64	445 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GUCD1	Q96NT3	240 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PADI3	Q9ULW8	664 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PTPRS	Q13332	1948 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339		A0A087WWV3	80 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LCHN	A4D1U4	455 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZBTB39	O15060	712 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GPR32	O75388	356 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SLITRK3	O94933	977 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FOSL2	P15408	326 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PTGDR	Q13258	359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FERMT3	Q86UX7	667 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NLRP4	Q96MN2	994 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	YME1L1	Q96TA2	773 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	EVPL	Q92817	2033 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GPR182	O15218	404 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PDC	P20941	246 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GPC3	P51654	580 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ODR4	Q5SWX8	454 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KSR1	Q8IVT5	923 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TMEM143	Q96AN5	459 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RAD9A	Q99638	391 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MTR	Q99707	1265 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RAB34	Q9BZG1	259 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339		A0A087WZ62	844 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ENPP3	O14638	875 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MED24	O75448	989 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ARHGEF15	O94989	841 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FGFR4	P22455	802 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	IGFBP4	P22692	258 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RFC5	P40937	340 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	EMC2	Q15006	297 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	POTEG	Q6S5H5	508 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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