RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 MFSD10Q14728 455 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 UBE2SQ16763 222 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 KANK3Q6NY19 840 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SERINC5Q86VE9 423 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 C7orf31Q8N865 590 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 KATNAL1Q9BW62 490 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 USP26Q9BXU7 913 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 COL4A3Q01955 1670 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ENPP3O14638 875 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 TREHO43280 583 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SORBS3O60504 671 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 PPFIA4O75335 1185 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 F2P00734 622 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ADRB1P08588 477 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 WEE2P0C1S8 567 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ADCY7P51828 1080 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SEMA3FQ13275 785 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 NEDD9Q14511 834 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 METTL7BQ6UX53 244 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 RUFY3Q7L099 469 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 NLRX1Q86UT6 975 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 GPRASP2Q96D09 838 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 CDHR1Q96JP9 859 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 POMKQ9H5K3 350 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 TLE6Q9H808 572 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 BARHL2Q9NY43 387 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ITPR1Q14643 2758 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTDSPL-208ENST00000486978 EMSYQ7Z589 1322 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 SMCO2A6NFE2 343 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 DGKIO75912 1065 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 SCG2P13521 617 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 TGM1P22735 817 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 TECP42680 631 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 EVCP57679 992 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 AP3B2Q13367 1082 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 MTMR3Q13615 1198 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 SEPT8Q92599 483 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 RUBCNQ92622 972 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 P2RX5Q93086 422 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 HINFPQ9BQA5 517 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 ERVK-5Q9HDB9 667 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 HCSTQ9UBK5 93 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 ESYT2A0FGR8 921 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 POTEMA6NI47 508 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 H3BRB1 525 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 MAFGO15525 162 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 CHRNA1P02708 482 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 LGALS2P05162 132 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSPL-208ENST00000486978 SP9P0CG40 484 aa7.32□□□□□ -1.24
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