RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 GNAT1P11488 350 aa5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 COL6A2P12110 1019 aa5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 ITGB6P18564 788 aa5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 TRIM68Q6AZZ1 485 aa5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 HAS1Q92839 578 aa5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 SLC26A4O43511 780 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 DLX3O60479 287 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 MSCO60682 206 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 ASMTLO95671 621 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 KCNQ1P51787 676 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 HGFACQ04756 655 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 PCOLCEQ15113 449 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 TCEA2Q15560 299 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 TKFCQ3LXA3 575 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 FAM209AQ5JX71 171 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 COLEC12Q5KU26 742 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 MRGPREQ86SM8 312 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 EXOC2Q96KP1 924 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 CDC6Q99741 560 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 IER2Q9BTL4 223 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.12□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 TRAF5O00463 557 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 PRODHO43272 600 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 ERBB2P04626 1255 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 FGFR1P11362 822 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 GRK2P25098 689 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 GRK3P35626 688 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 GYS2P54840 703 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 NSMFQ6X4W1 530 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 OSBP2Q969R2 916 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 FEZ1Q99689 392 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 ZAR1LA6NP61 321 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 CD38P28907 300 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 MRE11P49959 708 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 MEOX1P50221 254 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 STILQ15468 1287 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 KIZQ2M2Z5 673 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.1□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 RPS6KA4O75676 772 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 CDK4P11802 303 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 IL13RA1P78552 427 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 LBX2Q6XYB7 198 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 USP53Q70EK8 1073 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 LENG9Q96B70 501 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 WNK4Q96J92 1243 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 KCNJ15Q99712 375 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 GALNT8Q9NY28 637 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.09□□□□□ -1.59
PHC3-211ENST00000486042 PLD2O14939 933 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 ADCY8P40145 1251 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 SCNN1GP51170 649 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 NTRK3Q16288 839 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 RTKN2Q8IZC4 609 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 DCAF4Q8WV16 495 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 MIEF2Q96C03 454 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PHC3-211ENST00000486042 INCENPQ9NQS7 918 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms