RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 CTSHP09668 335 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 RARRES1P49788 294 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 HYIQ5T013 277 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 USP28Q96RU2 1077 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 MAP7D2Q96T17 732 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 SCN5AQ14524 2016 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.2■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 EFCAB14O75071 495 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 BRD1O95696 1058 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CLCN3P51790 818 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 PKP1Q13835 747 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 SEPT8Q92599 483 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 APBB2Q92870 758 aa20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 ASAP2O43150 1006 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 DGAT1O75907 488 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 IKBKEQ14164 716 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 LPIN1Q14693 890 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 ECM1Q16610 540 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 TCP11Q8WWU5 503 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 AKT3Q9Y243 479 aa20.18■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 PP2D1A8MPX8 630 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 VTNP04004 478 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CDC25AP30304 524 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 ODR4Q5SWX8 454 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 POTEGQ6S5H5 508 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 DNM3Q9UQ16 869 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.17■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 PPP6R2O75170 966 aa20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 YEATS4O95619 227 aa20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 GPC3P51654 580 aa20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 DRP2Q13474 957 aa20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CFAP45Q9UL16 551 aa20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.16■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A087WWV3 80 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 EYA4O95677 639 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 GHRP10912 638 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 UBA7P41226 1012 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 EMC2Q15006 297 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 KIZQ2M2Z5 673 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CABP7Q86V35 215 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF410Q86VK4 478 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 MTRQ99707 1265 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CNKSR1-208ENST00000484874 GPR182O15218 404 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 CYP11B2P19099 503 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 DDIT3P35638 169 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 GRIN1Q05586 938 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 POU5F1BQ06416 359 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 STK38Q15208 465 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 TCTN1Q2MV58 587 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.14■□□□□ 0.81
CNKSR1-208ENST00000484874 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms