RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484375.5

ARPC1B-218, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC1B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-218ENST00000484375 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.17■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.17■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.17■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 TCHHQ07283 1943 aa25.17■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 TMEM150BA6NC51 233 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 ITGB8P26012 769 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 CCL23P55773 120 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 NPEPPSP55786 919 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM26DQ5JW98 314 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 SPATA32Q96LK8 384 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.16■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 EYA4O95677 639 aa25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 ME1P48163 572 aa25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 GRIN1Q05586 938 aa25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 EMC2Q15006 297 aa25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 LINC01465Q8N7H1 131 aa25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 MTRQ99707 1265 aa25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 AKT3Q9Y243 479 aa25.15■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 CLCN3P51790 818 aa25.14■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa25.14■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.14■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.14■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 TRPV2Q9Y5S1 764 aa25.14■■□□□ 1.62
ARPC1B-218ENST00000484375 CEP290O15078 2479 aa25.14■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 SIP14410 1827 aa25.14■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 ZBTB39O15060 712 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CTSHP09668 335 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CSF2RAP15509 400 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 ECM1Q16610 540 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 USP38Q8NB14 1042 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 SCLYQ96I15 445 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CLIC6Q96NY7 704 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 GDF15Q99988 308 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 IL23AQ9NPF7 189 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 SQORQ9Y6N5 450 aa25.13■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 SCN5AQ14524 2016 aa25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 BMP8BP34820 402 aa25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 MGAT3Q09327 533 aa25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 GRB10Q13322 594 aa25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 PNMA5Q96PV4 448 aa25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 KCND2Q9NZV8 630 aa25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.12■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 ASAP2O43150 1006 aa25.11■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 ODR4Q5SWX8 454 aa25.11■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 PADI6Q6TGC4 694 aa25.11■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 EPSTI1Q96J88 318 aa25.11■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 STK17AQ9UEE5 414 aa25.11■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 E9PMD0 336 aa25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CXCL10P02778 98 aa25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 ACTN1P12814 892 aa25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF410Q86VK4 478 aa25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 TIPINQ9BVW5 301 aa25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.1■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CHRNA1P02708 482 aa25.09■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 VTNP04004 478 aa25.09■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CYP11B2P19099 503 aa25.09■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 PLCG1P19174 1290 aa25.09■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.09■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 SPECC1Q5M775 1068 aa25.09■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 APBB2Q92870 758 aa25.09■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 SCLT1Q96NL6 688 aa25.09■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 GPC3P51654 580 aa25.08■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 TMEM62Q0P6H9 643 aa25.08■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.08■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 ADALQ6DHV7 355 aa25.08■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.08■■□□□ 1.61
ARPC1B-218ENST00000484375 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms