RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483670.5

PDCD4-208, Transcript of programmed cell death 4, human

TSL 5

Gene PDCD4, Length 774 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD4-208	ENST00000483670	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	AMH	P03971	560 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	DNAJB2	P25686	324 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	CLCN3	P51790	818 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	PBX4	Q9BYU1	374 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	SZT2	Q5T011	3432 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	TMEM150B	A6NC51	233 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	VTN	P04004	478 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	RPA1	P27694	616 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	PAK2	Q13177	524 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	XKR9	Q5GH70	373 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	TIFA	Q96CG3	184 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	GINS2	Q9Y248	185 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	ARID2	Q68CP9	1835 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	GPR32	O75388	356 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	TCTN1	Q2MV58	587 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	NACC1	Q96RE7	527 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	GBF1	Q92538	1859 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	GPR182	O15218	404 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	STX6	O43752	255 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	RPS6KA5	O75582	802 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	CD52	P31358	61 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	NPEPPS	P55786	919 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	DEFB123	Q8N688	67 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	TCP11	Q8WWU5	503 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	PADI3	Q9ULW8	664 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PDCD4-208	ENST00000483670	FERMT3	Q86UX7	667 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	PTPRS	Q13332	1948 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	DGAT1	O75907	488 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	GJB5	O95377	273 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	GPC3	P51654	580 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	DEFB103A	P81534	67 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF410	Q86VK4	478 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	SCLT1	Q96NL6	688 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	OSMR	Q99650	979 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	MED24	O75448	989 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	PBX2	P40425	430 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	RARRES1	P49788	294 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	KRT79	Q5XKE5	535 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	NLRP7	Q8WX94	980 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	MTMR6	Q9Y217	621 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	ASAP2	O43150	1006 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	TLL1	O43897	1013 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	RABGGTB	P53611	331 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	EMC2	Q15006	297 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	RAD9A	Q99638	391 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	MTR	Q99707	1265 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	ZBTB39	O15060	712 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	REST	Q13127	1097 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PDCD4-208	ENST00000483670	TOP1MT	Q969P6	601 aa		28.78	■■■□□ 2.2

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