RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482988.1

DNAJB2-216, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2, human

TSL 2

Gene DNAJB2, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNAJB2-216	ENST00000482988	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	FAM228A	Q86W67	206 aa		32.41	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	POF1B	Q8WVV4	589 aa		32.41	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	MAP7D2	Q96T17	732 aa		32.41	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	IGFLR1	Q9H665	355 aa		32.41	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	AAAS	Q9NRG9	546 aa		32.41	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		32.41	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	TBX10	O75333	385 aa		32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	GPR32	O75388	356 aa		32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	ADAM15	Q13444	863 aa		32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	RIT2	Q99578	217 aa		32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	DISC1	Q9NRI5	854 aa		32.4	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	PRR33	A8MZF0	331 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	MBTPS2	O43462	519 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	PPFIA3	O75145	1194 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	TMOD1	P28289	359 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	UBE3A	Q05086	875 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	RUFY3	Q7L099	469 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		32.39	■■■□□ 2.78
DNAJB2-216	ENST00000482988	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	MSH4	O15457	936 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	SFN	P31947	248 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	NLRP5	P59047	1200 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	CLUL1	Q15846	466 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	CD207	Q9UJ71	328 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	AKT3	Q9Y243	479 aa		32.38	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	LINC01565	O15544	149 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	DCX	O43602	365 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	GAS7	O60861	476 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	OAT	P04181	439 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	IRS1	P35568	1242 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	NDUFV1	P49821	464 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	CLCN3	P51790	818 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	JAK3	P52333	1124 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	FAM189B	P81408	668 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	EFHB	Q8N7U6	833 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		32.37	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	PRKCE	Q02156	737 aa		32.36	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	DSC3	Q14574	896 aa		32.36	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		32.36	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	SLC5A5	Q92911	643 aa		32.36	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		32.36	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	C5orf42	Q9H799	3197 aa		32.36	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	EDIL3	O43854	480 aa		32.35	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	ZNF862	O60290	1169 aa		32.35	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		32.35	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		32.35	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		32.35	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		32.35	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	RDM1	Q8NG50	284 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	TBCK	Q8TEA7	893 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		32.34	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	FSD2	A1L4K1	749 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	CPLX1	O14810	134 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	HOXA2	O43364	376 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	CHMP2A	O43633	222 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	DEXI	O95424	95 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	EYA4	O95677	639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	NRIP1	P48552	1158 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988		Q4G0T1	1027 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	TLR9	Q9NR96	1032 aa		32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
DNAJB2-216	ENST00000482988	FGF18	O76093	207 aa		32.32	■■■□□ 2.76
DNAJB2-216	ENST00000482988	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
DNAJB2-216	ENST00000482988	LAG3	P18627	525 aa		32.32	■■■□□ 2.76
DNAJB2-216	ENST00000482988	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		32.32	■■■□□ 2.76
DNAJB2-216	ENST00000482988	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		32.32	■■■□□ 2.76
DNAJB2-216	ENST00000482988	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		32.32	■■■□□ 2.76
DNAJB2-216	ENST00000482988	FGFR1	P11362	822 aa		32.31	■■■□□ 2.76
DNAJB2-216	ENST00000482988	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		32.31	■■■□□ 2.76
DNAJB2-216	ENST00000482988	COASY	Q13057	564 aa		32.31	■■■□□ 2.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms