RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 HYIQ5T013 277 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 TCP11Q8WWU5 503 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 WNT8BQ93098 351 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 PFKMP08237 780 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 IQCF3P0C7M6 154 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CLCN3P51790 818 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CDC42EP1Q00587 391 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 GRIN1Q05586 938 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 EMC2Q15006 297 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CLIC6Q96NY7 704 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 MTRQ99707 1265 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ZBTB39O15060 712 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 EYA4O95677 639 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ITGB8P26012 769 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 SCLYQ96I15 445 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 SCLT1Q96NL6 688 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CSF2RAP15509 400 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 ECM1Q16610 540 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM26DQ5JW98 314 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-212ENST00000472427 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 GRB10Q13322 594 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 SPECC1Q5M775 1068 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 PADI6Q6TGC4 694 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 EPSTI1Q96J88 318 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP89Q96ST8 783 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 PLIN2Q99541 437 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 IL23AQ9NPF7 189 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A087WWV3 80 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 E9PMD0 336 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 PNMA5Q96PV4 448 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 GINS2Q9Y248 185 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 VTNP04004 478 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 ACTN1P12814 892 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 PLCG1P19174 1290 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 ODR4Q5SWX8 454 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 USP38Q8NB14 1042 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 NLRP7Q8WX94 980 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 STK17AQ9UEE5 414 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 ASAP2O43150 1006 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 MGAT3Q09327 533 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM143Q96AN5 459 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 GDF15Q99988 308 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 KCND2Q9NZV8 630 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 SQORQ9Y6N5 450 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 EVPLQ92817 2033 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 CHRNA1P02708 482 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 PLA2G4BP0C869 781 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP11B2P19099 503 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 STAT6P42226 847 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 TFDP1Q14186 410 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 KIZQ2M2Z5 673 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms