RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 MTERF2Q49AM1 385 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 POTEGQ6S5H5 508 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF410Q86VK4 478 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 MAP7D2Q96T17 732 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC9A7Q96T83 725 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 ADAMTS10Q9H324 1103 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 SZT2Q5T011 3432 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 M0QZ92 97 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DGAT1O75907 488 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 F13A1P00488 732 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 GHRP10912 638 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMOD1P28289 359 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DDIT3P35638 169 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPC3P51654 580 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 NPEPPSP55786 919 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDC42EP1Q00587 391 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DRP2Q13474 957 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 PKP1Q13835 747 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 BECN1Q14457 450 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 SEPT8Q92599 483 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 CEP170P1Q96L14 293 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.935e-6■■■□□ 14.7
TRAPPC3-206ENST00000469757 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 PP2D1A8MPX8 630 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZBTB39O15060 712 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 YEATS4O95619 227 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 BRD1O95696 1058 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 VTNP04004 478 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DARSP14868 501 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 ECM1Q16610 540 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 KIZQ2M2Z5 673 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATL3Q6DD88 541 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 TPH2Q8IWU9 490 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 METTL13Q8N6R0 699 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 NACC1Q96RE7 527 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 USP28Q96RU2 1077 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLIC4Q9Y696 253 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 EVPLQ92817 2033 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDH23Q9H251 3354 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 EYA4O95677 639 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD52P31358 61 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 KCNJ6P48051 423 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DNM2P50570 870 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 DEFB103AP81534 67 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 POU5F1BQ06416 359 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 PAK2Q13177 524 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 IKBKEQ14164 716 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC39A14Q15043 492 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB30Q15771 203 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 XKR9Q5GH70 373 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 KRT79Q5XKE5 535 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM228AQ86W67 206 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms