RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469271.1

NOM1-203, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 1,209 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-203ENST00000469271 RPA1P27694 616 aa22.91■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 CLCN3P51790 818 aa22.91■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 LPIN1Q14693 890 aa22.91■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.91■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.91■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 MTMR6Q9Y217 621 aa22.91■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 TET1Q8NFU7 2136 aa22.91■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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NOM1-203ENST00000469271 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.9■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.9■■□□□ 1.26
NOM1-203ENST00000469271 LRCH3Q96II8 777 aa22.9■■□□□ 1.26
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NOM1-203ENST00000469271 RAB30Q15771 203 aa22.89■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 NACC1Q96RE7 527 aa22.89■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 BECN1Q14457 450 aa22.88■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 KIZQ2M2Z5 673 aa22.88■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 KRT79Q5XKE5 535 aa22.88■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.88■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 MED24O75448 989 aa22.87■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 DGAT1O75907 488 aa22.87■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 AMHP03971 560 aa22.87■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 TCP11Q8WWU5 503 aa22.87■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 SCLT1Q96NL6 688 aa22.87■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 RARRES1P49788 294 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 EMC2Q15006 297 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 ZNF410Q86VK4 478 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 AK8Q96MA6 479 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 OSMRQ99650 979 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 PADI3Q9ULW8 664 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.86■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 SZT2Q5T011 3432 aa22.86■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 CD52P31358 61 aa22.85■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 GPC3P51654 580 aa22.85■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 IL17AQ16552 155 aa22.85■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 TCTN1Q2MV58 587 aa22.85■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.85■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.85■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 NLRP7Q8WX94 980 aa22.85■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 PBX4Q9BYU1 374 aa22.85■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 SIP14410 1827 aa22.85■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.84■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.84■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 TIFAQ96CG3 184 aa22.84■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.84■■□□□ 1.25
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NOM1-203ENST00000469271 SLC26A4O43511 780 aa22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 DEFB103AP81534 67 aa22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 DRP2Q13474 957 aa22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.83■■□□□ 1.25
NOM1-203ENST00000469271 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.82■■□□□ 1.24
NOM1-203ENST00000469271 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NOM1-203ENST00000469271 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NOM1-203ENST00000469271 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NOM1-203ENST00000469271 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.82■■□□□ 1.24
NOM1-203ENST00000469271 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.82■■□□□ 1.24
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