RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.95■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.95■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 NEK9Q8TD19 979 aa22.95■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 CEP170P1Q96L14 293 aa22.95■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 RAD9AQ99638 391 aa22.95■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 OSMRQ99650 979 aa22.95■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 RGL1Q9NZL6 768 aa22.95■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.95■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.261e-7■■■■□ 25.5
SCAF8-204ENST00000461219 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 GRIN2CQ14957 1233 aa22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 ERMNQ8TAM6 284 aa22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 NLRP7Q8WX94 980 aa22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 YME1L1Q96TA2 773 aa22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 PADI3Q9ULW8 664 aa22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 INSL6Q9Y581 213 aa22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.94■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 GPR182O15218 404 aa22.93■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 TECP42680 631 aa22.93■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 XKR9Q5GH70 373 aa22.93■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 ANO5Q75V66 913 aa22.93■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 C4orf19Q8IY42 314 aa22.93■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 MTMR9Q96QG7 549 aa22.93■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.93■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.93■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 DENND3A2RUS2 1198 aa22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 POTEMA6NI47 508 aa22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 CDC42EP1Q00587 391 aa22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 RAB34Q9BZG1 259 aa22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 CERS4Q9HA82 394 aa22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 PPME1Q9Y570 386 aa22.92■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 TTC3P53804 2025 aa22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 PDCP20941 246 aa22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 IGFBP4P22692 258 aa22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 NPEPPSP55786 919 aa22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 NBR1Q14596 966 aa22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 TOP1MTQ969P6 601 aa22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 STBD1O95210 358 aa22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 RFC5P40937 340 aa22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.9■■□□□ 1.26
SCAF8-204ENST00000461219 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ENPP3O14638 875 aa22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 GPR32O75388 356 aa22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 SLITRK3O94933 977 aa22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 STAG3L1P0CL83 205 aa22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 HSCBQ8IWL3 235 aa22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.89■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 LCHNA4D1U4 455 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 GPC3P51654 580 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 TAP1Q03518 808 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 PTGDRQ13258 359 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 CUL4AQ13619 759 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 TCP11Q8WWU5 503 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 NLRP4Q96MN2 994 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.88■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 LAD1O00515 517 aa22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 EMC2Q15006 297 aa22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 MTRQ99707 1265 aa22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 ADAM2Q99965 735 aa22.87■■□□□ 1.25
SCAF8-204ENST00000461219 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms