RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 ERVK-5Q9HDB9 667 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 WNT7AO00755 349 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 PSMC5P62195 406 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 GUCY1B3Q02153 619 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 RABEP1Q15276 862 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 OSMRQ99650 979 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 MYO7AQ13402 2215 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 RPS6KA5O75582 802 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 TMOD1P28289 359 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 MTERF2Q49AM1 385 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 MAP7D2Q96T17 732 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 AKT3Q9Y243 479 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 MARCH6O60337 910 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 C8orf76Q96K31 380 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 QARSP47897 775 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 ANO5Q75V66 913 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 ADAMTS10Q9H324 1103 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 MGEA5O60502 916 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 FAM228AQ86W67 206 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-202ENST00000460160 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 P4HBP07237 508 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 DRP2Q13474 957 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 EPHA7Q15375 998 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 EPC2Q52LR7 807 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO22Q8NEZ5 403 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 GPR182O15218 404 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 DGKIO75912 1065 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 CALCRLQ16602 461 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 NPAS4Q8IUM7 802 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 SAMD11Q96NU1 681 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 NEMFO60524 1076 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 LINC00271P0C7V0 271 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 GPC3P51654 580 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ODR4Q5SWX8 454 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 FIBCD1Q8N539 461 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 LXNQ9BS40 222 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 RGL1Q9NZL6 768 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 MUC3AQ02505 3323 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ARID2Q68CP9 1835 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ST18O60284 1047 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM192Q8IY95 271 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 MTMR9Q96QG7 549 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ADAM2Q99965 735 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 LMCD1Q9NZU5 365 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 DLL1O00548 723 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
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HOXB3-202ENST00000460160 NPEPPSP55786 919 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 C4orf19Q8IY42 314 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 DYDC2Q96IM9 177 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 RGS18Q9NS28 235 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 THEGQ9P2T0 379 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 BDP1A6H8Y1 2624 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 DENND3A2RUS2 1198 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 STAG3L1P0CL83 205 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 DARSP14868 501 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 ATP2B1P20020 1258 aa26.52■■□□□ 1.84
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